Вместе с пакетом документов для регистрации нужно подать специальное уведомление о переходе на УСН.
Скачать бланк уведомления о переходе на УСН можно здесь.
Советую заполнить уведомление не в одном экземпляре, а в двух. В таком случае один экземпляр вы отдадите в налоговую, а на втором специалист-регистратор поставит вам штамп о приеме и вернет. Это уведомление нужно хранить вместе с другими документами ООО.
Если вдруг налоговая служба будет утверждать, что вы не подавали никакого заявления на УСН, у вас на руках будет документ, подтверждающий вашу правоту.
Чем еще может быть полезен для Вас Праводокс: